境内主要河流走向均自北向南，除度门、柴井、新政3个乡镇外、其余53个乡镇属渠江水系流域。仪陇河、新寺河、观音河三条主要河流属渠江水系。此外县东北的福临乡、张公镇、来仪乡境各有一条小河经巴中注入渠江。仪陇河境内主河道长83公里，大小支流165条，总长420公里，县内总落差74米。新寺河境内主河道长61公里，大小支流71条，县内 总落差59米。观音河境内主河道长62公里，大小支流93条，县内总落差163.5米，水能资源较丰富，思德水库，板桥电站均建在此河道上。
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